Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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