Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPTX1Q15818 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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