Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PUM3Q15397 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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