Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ARHGDIA-205ENST00000579121 637 ntTSL 314.83□□□□□ -0.042e-16■■■□□ 16.2
PCBP2Q15366 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-16■■■□□ 16.2
PCBP2Q15366 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.391e-16■■■□□ 16.2
PCBP2Q15366 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.071e-16■■■□□ 16.2
PCBP2Q15366 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-16■■■□□ 16.2
PCBP2Q15366 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.191e-16■■■□□ 16.2
PCBP2Q15366 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 511.27□□□□□ -0.612e-14■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 BAX-207ENST00000502487 1346 ntTSL 1 (best)25.01■■□□□ 1.591e-10■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.371e-10■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 BAX-211ENST00000513545 775 ntTSL 320.28■□□□□ 0.841e-10■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-10■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.221e-10■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 PPP1R10-206ENST00000484449 605 ntTSL 55.35□□□□□ -1.554e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -12e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.165e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.775e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-219ENST00000480929 2421 ntTSL 210.09□□□□□ -0.795e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -15e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-217ENST00000475950 587 ntTSL 38.36□□□□□ -1.075e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-204ENST00000417196 811 ntTSL 57.35□□□□□ -1.235e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-214ENST00000465558 1688 ntTSL 27.34□□□□□ -1.235e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-221ENST00000494428 829 ntTSL 37.27□□□□□ -1.255e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-207ENST00000434241 476 ntTSL 57.04□□□□□ -1.285e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.325e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-218ENST00000480472 765 ntTSL 46.71□□□□□ -1.345e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTLL4-215ENST00000467841 973 ntTSL 46.46□□□□□ -1.385e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-8■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.821e-8■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TTC21B-202ENST00000392695 1572 ntTSL 55.5□□□□□ -1.536e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 FCGRT-216ENST00000599701 579 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 FCGRT-213ENST00000598491 578 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.26e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 AP1G2-204ENST00000465445 2554 ntTSL 512.71□□□□□ -0.386e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 AP1G2-205ENST00000535852 2471 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.436e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 AP1G2-203ENST00000460049 2672 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.436e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.566e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.041e-8■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.271e-8■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 PLK1-204ENST00000564202 584 ntTSL 315.03■□□□□ -03e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 PLK1-209ENST00000570220 910 ntTSL 315.02■□□□□ -03e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 PLK1-208ENST00000568568 582 ntTSL 314.27□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 PLK1-207ENST00000567897 711 ntTSL 313.42□□□□□ -0.263e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.417e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.037e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 516.72■□□□□ 0.273e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 512.04□□□□□ -0.483e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.585e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 517.53■□□□□ 0.45e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.365e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 216.26■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 310.65□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.322e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 55.97□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.472e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)4.64□□□□□ -1.672e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 53.77□□□□□ -1.812e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 33.76□□□□□ -1.812e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.145e-8■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TBC1D10B-203ENST00000475650 2484 ntTSL 215.13■□□□□ 0.015e-8■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TBC1D10B-205ENST00000478158 4614 ntTSL 212.47□□□□□ -0.415e-8■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 STAT5B-203ENST00000468312 1799 ntTSL 1 (best)22.53■■□□□ 1.29e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.019e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 STAT5B-202ENST00000415845 559 ntTSL 46.94□□□□□ -1.39e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 GOLGA2-202ENST00000450617 1439 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.815e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.125e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.228e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.298e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.298e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 DBNDD1-207ENST00000623401 2889 nt12.05□□□□□ -0.485e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.889e-19■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TERF2-209ENST00000569280 513 ntTSL 58.89□□□□□ -0.998e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 DCAF10-205ENST00000483167 2496 ntTSL 1 (best)8.23□□□□□ -1.098e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.318e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TET2-208ENST00000514870 865 ntTSL 46.48□□□□□ -1.378e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 ADAR-208ENST00000529168 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.24□□□□□ -1.418e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TET2-201ENST00000265149 9588 ntTSL 55.17□□□□□ -1.588e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.648e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.658e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.838e-12■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.346e-7■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 16.1
PCBP2Q15366 CLCN7-206ENST00000563822 851 ntTSL 513.71□□□□□ -0.217e-7■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MITD1-202ENST00000409107 662 ntTSL 38.83□□□□□ -13e-10■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.143e-10■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MITD1-203ENST00000413710 1083 ntTSL 57.09□□□□□ -1.273e-10■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MITD1-206ENST00000464685 3270 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.353e-10■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MITD1-207ENST00000466880 579 ntTSL 36.56□□□□□ -1.363e-10■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MITD1-204ENST00000422537 971 ntTSL 56.05□□□□□ -1.443e-10■■■□□ 16
PCBP2Q15366 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 16
PCBP2Q15366 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.562e-7■■■□□ 16
PCBP2Q15366 DDX39B-219ENST00000481456 5158 ntTSL 211.18□□□□□ -0.621e-20■■■□□ 16
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 184.9 ms