Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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LAPTM4AQ15012 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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