Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TRIM25Q14258 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms