Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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KCNC3Q14003 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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KCNC3Q14003 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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