Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TUBA3CQ13748 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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TUBA3CQ13748 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TUBA3CQ13748 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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TUBA3CQ13748 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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TUBA3CQ13748 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TUBA3CQ13748 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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