Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAPSNQ13702 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms