Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms