Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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TOP3AQ13472 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TOP3AQ13472 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TOP3AQ13472 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TOP3AQ13472 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TOP3AQ13472 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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