Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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