Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NME3Q13232 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NME3Q13232 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NME3Q13232 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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