Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBX3Q13185 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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