Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RLFQ13129 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLFQ13129 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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