Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ACACAQ13085 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms