Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXM1Q08050 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms