Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPCQ03188 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms