Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GCNT1Q02742 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms