Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RELBQ01201 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RELBQ01201 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms