Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCE1P61221 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms