Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN2P57739 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms