Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms