Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNTAP49354 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms