Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ALDH9A1P49189 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms