Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A6P48664 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms