Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOX11P35716 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOX11P35716 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SOX11P35716 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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SOX11P35716 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOX11P35716 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOX11P35716 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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