Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms