Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2E1P29083 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms