Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNNA2P26232 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms