Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR2AP24928 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms