Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGS1P23219 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms