Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM21P19474 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms