Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TCP1P17987 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TCP1P17987 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms