Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB4P16144 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB4P16144 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms