Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH1P12830 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH1P12830 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH1P12830 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH1P12830 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDH1P12830 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH1P12830 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH1P12830 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDH1P12830 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms