Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOP2AP11388 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms