Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZBED1O96006 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ZBED1O96006 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ZBED1O96006 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZBED1O96006 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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