Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLDN9O95484 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLDN9O95484 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN9O95484 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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