Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNUPNO95149 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms