Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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