Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF14O43557 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms