Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ARHGEF9O43307 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms