Protein–RNA interactions for Protein: O14526

FCHO1, F-BAR domain only protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1O14526 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FCHO1O14526 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FCHO1O14526 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FCHO1O14526 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
FCHO1O14526 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FCHO1O14526 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms