Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E9PBE3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms