Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms