Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVV-1B6SEH8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVV-1B6SEH8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms