Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SDR42E2A6NKP2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms