Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CFAP69A5D8W1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms