Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRPRBQ9Y5M8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms